Kurzfassung

Ziel dieses Projektes ist es, neue geprägte Gene mit Hilfe der QUASEP-Methode, einer höchst präzisen Methode zur Detektion von allelischen Expressionsunterschieden, zu identifizieren. Aus einer kürzlich erschienenen Expressionsprofilanalyse von uniparentalen Maus-Embryonen und aus einer bioinformatischen Studie wurden 68 bzw. 20 geprägte Kandidatengene ausgewählt und analysiert. Ein neues Protein-kodierendes geprägtes Gen sowie drei neue geprägte Gene, die für putative nicht...Ziel dieses Projektes ist es, neue geprägte Gene mit Hilfe der QUASEP-Methode, einer höchst präzisen Methode zur Detektion von allelischen Expressionsunterschieden, zu identifizieren. Aus einer kürzlich erschienenen Expressionsprofilanalyse von uniparentalen Maus-Embryonen und aus einer bioinformatischen Studie wurden 68 bzw. 20 geprägte Kandidatengene ausgewählt und analysiert. Ein neues Protein-kodierendes geprägtes Gen sowie drei neue geprägte Gene, die für putative nicht Protein-kodierende RNAs kodieren, wurden auf der Basis der elternspezifischen monoallelischen Expression in d11.5 p.c. (C57BL/6J x Cast/Ei)F1-Embryonen und informativen d11.5 p.c. (C57BL/6 x Cast/Ei)F1 x C57BL/6 Embryonen identifiziert. Zudem wurden vier Transkripte mit präferentieller Expression eines stammspezifischen Allels gefunden. Interessanterweise zeigte der weitaus größte Teil der analysierten Transkripte keine Imprinting-assoziierte biallelische Expression in F1-Embryonen. Da für die überwiegende Mehrheit der analysierten Kandidatengene biallelische Expression nachgewiesen wurde, kommen wir zu dem Schluss, dass sowohl die Expressionsprofilanalyse von uniparentalen Maus-Embryonen als auch die bioinformatische Studie nur eine geringe Effizienz bei der Identifizierung von neuen geprägten Genen aufweisen.» weiterlesen» einklappen