Kurzfassung

Das Projekt diskutiert die Übertragbarkeit einer Genexpressionssignatur von einer experimentellen Microarray-Platform (z.B. Affymetrix) auf eine andere (z.B. Illumina). Wir entwickeln auf der Bioinformatik-Plattform R/Bioconductor einen Rahmen zur in-silico-Validierung der Robustheit genexpressionsbasierter Klassifikatoren gegenüber technischer und biologischer Variabilität, insbesondere gegenüber einem Wechsel der experimentellen Plattform. Gleichzeitig stellen wir ein neues rangbasiertes...Das Projekt diskutiert die Übertragbarkeit einer Genexpressionssignatur von einer experimentellen Microarray-Platform (z.B. Affymetrix) auf eine andere (z.B. Illumina). Wir entwickeln auf der Bioinformatik-Plattform R/Bioconductor einen Rahmen zur in-silico-Validierung der Robustheit genexpressionsbasierter Klassifikatoren gegenüber technischer und biologischer Variabilität, insbesondere gegenüber einem Wechsel der experimentellen Plattform. Gleichzeitig stellen wir ein neues rangbasiertes Klassifikationsverfahren vor, welches zum einen leicht interpretierbare Klassifikatoren produziert und zum anderen vergleichbar gute Resultate erzielt wie hochkomplexe Algorithmen wie Random Forests oder Support Vector Machines.» weiterlesen» einklappen