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Projekt cDNA-Tumordatenbank

Laufzeit: 01.01.2005 - 31.12.2007

Kurzfassung


Bisher konnte cDNA aus 50 Magenkarzinomen (Adenokarzinomen), 50 Ösophaguskarzinomen (Plattenepithel- und Adenokarzinome) und 100 Kolonkarzinomen (Adenokarzinome) sowie den entsprechenden Normalgeweben isoliert werden. Die RNA-Isolation geschieht mittels einer RNA-Säule (RNeasy Kit; Qiagen, Hilden) entsprechend den Empfehlungen des Herstellers. Nach der RNA-Isolation erfolgt eine reverse Transkription mittels des Omniscript Kits (Qiagen, Hilden) mit einer Ziel-cDNA-Konzentration von 100 ng/µl....Bisher konnte cDNA aus 50 Magenkarzinomen (Adenokarzinomen), 50 Ösophaguskarzinomen (Plattenepithel- und Adenokarzinome) und 100 Kolonkarzinomen (Adenokarzinome) sowie den entsprechenden Normalgeweben isoliert werden. Die RNA-Isolation geschieht mittels einer RNA-Säule (RNeasy Kit; Qiagen, Hilden) entsprechend den Empfehlungen des Herstellers. Nach der RNA-Isolation erfolgt eine reverse Transkription mittels des Omniscript Kits (Qiagen, Hilden) mit einer Ziel-cDNA-Konzentration von 100 ng/µl. Hiernach erfolgt eine Qualitätskontrolle durch den bereits etablierten Actin-Primer.
Die Tumordatenbank enthält neben dem pseudonymisierten Namen aller Patienten die periooperativen Parameter, die TNM-Klassifikation der Tumore, das Grading, die R-Klassifikation und das Langzeitüberleben. Die respektive Genexpression wird für jeden Patienten in unauffälligem Mukosagewebe und in Karzinomgewebe bestimmt.
Verschiedene Rezeptortyrosinkinasen wie VEGFR2, VEGFR3, PDGFRα, PDGFRβ, FLT3 sowie deren Liganden wurden in unterschiedlichen Tumorentitäten mit einer lymphogenen Metastasierung assoziiert. Während VEGFR2 und 3 die Proliferation und Migartion von Lymphendothelien in Richtung des den Liganden exprimierenden Tumors induzieren, stabilisieren PDGFRα/β positive Perizyten neuer Gefäße. Hierdurch wird die Neo-Lymphangiogenese des Tumors reguliert und eine lymphatische Metastasierung getriggert.
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Beteiligte Einrichtungen